首先，种蛋必须来自健康的种鸡群。其次是外观，即肉眼直接鉴别，鉴别项目如下：
(1)大小 种蛋大小要适中，每个品种都有一定的蛋重要求范围，超过标准范围±15%的蛋不应留作种用。
(2)形状 鸡蛋应成卵圆形；蛋型指数(蛋的纵径和横径之间的比率)应为1.30～1.35之间。
(3) 洁净度 种蛋必须保持蛋面清洁。新鲜的种蛋表面光滑，无斑点、污点，有光泽。若用水洗蛋，壳面的胶质脱落，微生物容易侵入内部，蛋内水分也容易蒸发，故一般种蛋尽量少用水洗。
(4)壳纹 种蛋的壳纹应当光滑，无皱折或凹凸不平等畸形。
(5)蛋壳颜色 纯种鸡的鸡蛋壳颜色一致，无斑点。
(6)蛋壳厚度 种蛋的蛋壳厚度应在0.33～0.35毫米。厚度小于0.27毫米时即为薄壳蛋，这种蛋水分蒸发较快，易被微生物侵入，又易破损。反之，蛋壳太厚(0.45毫米以上)，水分不易蒸发，气体交换困难，鸡胚不易啄破蛋壳而往往闷死。
为了进一步判断种蛋的质量，可以利用光照透视检验。新鲜种蛋气室很小，蛋黄清晰，浮于蛋内，并随蛋的转动而慢慢转动，蛋白浓度匀称，稀、浓两种蛋白也能明显辨别，蛋内无异物，蛋黄上的胚盘尚看不见，蛋黄表面无血丝、血块。若发现气室很大，蛋黄颜色变暗，蛋黄上甚至有血管，那是陈旧蛋。若发现蛋内容物全部变黑，这是因为保存时间过长，细菌侵入蛋内，使蛋白分解腐败已成臭蛋。如果发现蛋黄和蛋白混淆在一起，分辨不清，即为散黄蛋。